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2º semestre 2025
Programa de Pós-graduação em Ecologia e Evolução (PPGEE)
Seminários em Ecologia e Evolução (OBRIGATÓRIA AOS ALUNOS DO PPGEE)
O objetivo dessa disciplina é a discussão dos projetos e resultados em andamento das dissertações tanto com os docentes quanto entre alunos. Nesta disciplina, os alunos farão uma apresentação oral do seu projeto ou dissertação em andamento e eles serão arguidos por no mínimo três professores do programa além dos colegas presentes
Modalidade: presencial
Data/horário: 15-19/09, horários a combinar
Docente(s): Profa. Dra. Camila Castanho, Prof. Dr. Thomas Püttker
Contato: ppgee@unifesp.br
Bioinformática Geral (Tópicos especiais em Ecologia e Evolução)
O curso de Bioinformática tem como objetivo central conduzir os alunos a uma jornada de descoberta no fascinante universo onde a biologia e a ciência de dados se encontram. A proposta é capacitar os estudantes a compreenderem a revolução que as ciências biológicas vêm experimentando, impulsionada pela aplicação de métodos matemáticos, computacionais e estatísticos. O foco principal é explorar a intrincada dinâmica molecular dos seres vivos, desvendando os mecanismos da evolução das espécies, as tecnologias de ponta para medição de fenômenos moleculares e os vastos repositórios públicos de dados biológicos. Os alunos serão imersos em um aprendizado prático, com a introdução às técnicas de processamento de dados, ferramentas essenciais para extrair informações biológicas relevantes. Além disso, terão a oportunidade de analisar exemplos reais de problemas e soluções em bioinformática, aprofundando sua compreensão e desenvolvendo habilidades práticas para enfrentar os desafios do mundo real.
Modalidade:híbrida
Data/horário: 04/08-08/08, 8.00-12.00 h; dia 08/08 presencial, 05-08/08 virtual (à distância)
Docente(s): Prof. Dr. Edson Adriano e Dr. Amr Galal A. Ibrahim
Contato: adriano@unifesp.br
Introdução à linguagem R
A linguagem de programação R é uma ferramenta muito útil para diversos objetivos na ciência, incluindo organização de dados, estatística descritiva, estatística inferencial, elaboração de figuras e gráficos, entre outros. Esse curso foca na introdução na linguagem, direcionado as/os alunas/os sem experiência prévia com R. O curso foca na aprendizagem de operações básicas e da lógica geral de R, com o objetivo de fornecer aos/às alunas/os um acesso inicial ao R, sem inclusão de conteúdo estatístico.
Modalidade: presencial (Unifesp Diadema)
Data/horário:14/08, 15/08, 18/08, e 19/08 de 8.00 até 12.00 e de 14.00 até 18.00 h; 20/08 de 8.00 até 12.00
Docente(s): Prof. Dr. Thomas Püttker, Dra. Amanda Vieira da Silva (UFABC)
Contato: tputtker@unifesp.br
Aspectos históricos e conceituais da sistemática filogenética
História da sistemática e as escolas taxonômicas. Sistemática Filogenética. Princípios e métodos de inferência filogenética. Aspectos históricos, filosóficos e metodológicos da máxima parcimônia, máxima verossimilhança e análise bayesiana. Taxonomia integrativa.
Modalidade:híbrida
Data/horário: 3/09 de 8.00 à 12.00 h (a distância), 5/09 de 8.00 à 12.00 h (a distância), 8/09 de 8.00 à 12.00 h (a distância) , 10/09 de 8.00 à 12.00 h (a distância), 12/09 de 8.00 à 12.00 h e de 14.00 à 18.00 presencial (Unifesp Diadema)
Docente(s): Profa. Dra. Carla Poleselli Bruniera,
Contato: cpbruniera@unifesp.br
Inferência filogenética
Histórico. Delineamento de projetos em filogenia morfológica e molecular. Preparação da matriz de dados. Princípios em bioinformática e instalação dos programas. Caracteres morfológicos: descrição e codificação. Sequências de DNA: amostragem, escolha das regiões, alinhamento, qualidade dos dados. Critério da Parcimônia Máxima. Pesagem. Grupo externo e polarização de caracteres. Modelos de substituição. Métodos de distância. Critérios de Verossimilhança Máxima e Inferência Bayesiana.
Modalidade: presencial
Data/horário: 29/09–03/10 e 6/10–10/10 de 8.00 à 12.00 h, e de 14:00 à 18.00
Docente(s): Prof. Dr. Marcelo Sturaro
Contato: mjsturaro@unifesp.br
Filogeografia Estatística
Conceitos e aplicações de métodos filogeográficos estatísticos. Desenho amostral e analítico. Introdução à linguagem de programação. Uso de diferentes tipos de marcadores moleculares em filogeografia. Testes de hipóteses filogeográficas. Modelos coalescentes. Métodos espacialmente explícitos.
Modalidade: híbrido
Data/horário: 01/12 a 06/12 e 08/12 a 12/12 de 8.00 à 12.00 h, e de 14:00 à 18.00 (dia 12/12 presencial)
Docente(s): Profa. Dra. Cinthia Brasileiro
Contato: cinthia.brasileiro@unifesp.br
Formação prática do pesquisador-docente e o ingresso na carreira acadêmica
Tratar das práticas pedagógicas no Ensino Superior. Analisar criticamente o processo de formação dos pós-graduandos e as diversas atividades de um docente pesquisador, desde a docência, orientação, pesquisa, captação de recursos, etc. Abordar as questões éticas relacionadas com pesquisa, orientação, instituição e pares. Compreender o processo seletivo para ingresso na carreira acadêmica.
Modalidade: híbrida
Data/horário: 24/10, 31/10, 07/11 e 14/11 14:00 à 18.00 aula virtual (à distância); 21/11 de 14:00 à 18.00 presencial
Docente(s): Profa. Dra. Maria Beatriz Rossi Caruzo, Profa. Dra. Cibele Bragagnolo
Contato: mbrcaruzo@unifesp.br, cbragagnolo@unifesp.br
Termofisiologia dos vertebrados
Da fluidez das membranas celulares à distribuição geográfica das espécies, a biologia dos animais é influenciada em diversos níveis pela temperatura. Nessa disciplina os alunos explorarão de maneira dinâmica os temas fundamentais da termofisiologia dos vertebrados. Através de uma abordagem comparativa e evolutiva, examinaremos desde os princípios físicos até os impactos da temperatura em escalas populacionais.
Modalidade:híbrida
Data/horário: 29/10 presencial Unifesp Diadema de 8.00 à 12.00 h, 03/11-09/11 à distância de 8.00 à 12.00 h
Docente(s): Dr. Daniel Stuginski
Contato: daniel.stuginski@gmail.com
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